Roku 1832 zřídil Bedřich Frey starší ve Vysočanech první primitivní výrobnu cukru a roku 1835 otevřel ve Vysočanech svůj nový parní cukrovar. Hlavní objekt cukrovaru byl postaven v empírovém stylu. Jako jeden z prvních zde zavedl hydraulické lisy.
V tomto období přebírá vedoucí pozici v továrně Bedřich Frey mladší, který pokračuje v otcově odkazu a dál cukrovar rozvíjí. Začal ve zdokonalování výroby spolupracovat s plzeňským průmyslníkem, člověkem všestranného technického nadání Hugo Jelínkem. Roku 1863 provedli první saturaci cukrové šťávy (tzv. Frey-Jelínkovu saturace).
O tom, že byl Bedřich Frey průkopníkem ve všech
ohledech svědčí i skutečnost, že zde 21. května 1881 byla mezi jeho bytem a
cukrovarem zavedena 1. telefonní linka v Praze. Vysočany byly pražskou
výspou průmyslové moderny.
V roce
1915 byla výroba v cukrovaru ukončena. Následovala přestavba areálu pro nové
využití, kterou provedl na počátku 30. let minulého století stavitel Hejduk. V
areálu následně sídlily různé menší firmy, z nichž některé se později
významně zapsaly do průmyslové historie Prahy. Založena zde byla například i
továrna Avia a své první pokusy zde prováděl motocyklový konstruktér J. F.
Koch.
Po
skončení 2. světové války byl areál bývalého Freyova cukrovaru přidružen
k sousedním Odkolkovým pekárnám a spolu s nimi byl v roce 1947
znárodněn.
Po roce 1990 by podnik zahrnující areál Pekáren Odkolek i bývalého Freyova cukrovaru privatizován. V roce 1994 zde byla ukončena výroba. Od roku 2005 zůstávají areály bývalých pekáren Odkolek i Freyova cukrovaru opuštěny a postupně chátrají.